MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 75679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013851	GAT	2	6	195393	195398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939942
4002	NC_013851	GC	3	6	195407	195412	0 %	0 %	50 %	50 %	288939942
4003	NC_013851	GGTC	2	8	195485	195492	0 %	25 %	50 %	25 %	288939942
4004	NC_013851	GTC	2	6	195510	195515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939942
4005	NC_013851	TCG	2	6	195777	195782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4006	NC_013851	CGGG	2	8	195786	195793	0 %	0 %	75 %	25 %	288939943
4007	NC_013851	GACG	2	8	195817	195824	25 %	0 %	50 %	25 %	288939943
4008	NC_013851	CAT	2	6	195857	195862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939943
4009	NC_013851	GT	3	6	195948	195953	0 %	50 %	50 %	0 %	288939943
4010	NC_013851	GC	5	10	195973	195982	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4011	NC_013851	CTA	2	6	196033	196038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939943
4012	NC_013851	CGA	2	6	196120	196125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4013	NC_013851	CCGG	2	8	196172	196179	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4014	NC_013851	GGC	2	6	196198	196203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
4015	NC_013851	CGC	2	6	196227	196232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939943
4016	NC_013851	CG	3	6	196241	196246	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4017	NC_013851	GCCG	2	8	196286	196293	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4018	NC_013851	ATC	2	6	196304	196309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939943
4019	NC_013851	TCG	2	6	196340	196345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4020	NC_013851	CTCGA	2	10	196352	196361	20 %	20 %	20 %	40 %	288939943
4021	NC_013851	GCA	2	6	196390	196395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4022	NC_013851	CTG	2	6	196439	196444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4023	NC_013851	CAT	2	6	196504	196509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939943
4024	NC_013851	CGG	2	6	196510	196515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
4025	NC_013851	CCGA	2	8	196580	196587	25 %	0 %	25 %	50 %	288939943
4026	NC_013851	CGT	2	6	196618	196623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4027	NC_013851	CGT	2	6	196645	196650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4028	NC_013851	GC	3	6	196691	196696	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4029	NC_013851	CGC	2	6	196707	196712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939943
4030	NC_013851	CG	4	8	196735	196742	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4031	NC_013851	CGG	2	6	196794	196799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
4032	NC_013851	GGC	2	6	196872	196877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
4033	NC_013851	TCG	2	6	196890	196895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4034	NC_013851	TCTG	2	8	196914	196921	0 %	50 %	25 %	25 %	288939943
4035	NC_013851	GC	4	8	196961	196968	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4036	NC_013851	GGC	2	6	196982	196987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
4037	NC_013851	GC	3	6	197021	197026	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4038	NC_013851	CGG	2	6	197059	197064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
4039	NC_013851	GC	3	6	197066	197071	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4040	NC_013851	GGCCG	2	10	197083	197092	0 %	0 %	60 %	40 %	288939943
4041	NC_013851	TCAGTG	2	12	197094	197105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288939943
4042	NC_013851	CTG	2	6	197117	197122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
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4044	NC_013851	GGA	2	6	197182	197187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939943
4045	NC_013851	GGAT	2	8	197215	197222	25 %	25 %	50 %	0 %	288939943
4046	NC_013851	GCG	2	6	197226	197231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
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4049	NC_013851	CG	3	6	197280	197285	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4050	NC_013851	CGG	2	6	197312	197317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
4051	NC_013851	GC	3	6	197322	197327	0 %	0 %	50 %	50 %	288939943
4052	NC_013851	GGA	2	6	197344	197349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939943
4053	NC_013851	GGT	2	6	197359	197364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939943
4054	NC_013851	CGT	2	6	197365	197370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4055	NC_013851	GCGA	2	8	197423	197430	25 %	0 %	50 %	25 %	288939943
4056	NC_013851	ATT	2	6	197481	197486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288939943
4057	NC_013851	GCA	2	6	197488	197493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4058	NC_013851	CGG	2	6	197500	197505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939943
4059	NC_013851	CGATC	2	10	197518	197527	20 %	20 %	20 %	40 %	288939943
4060	NC_013851	CGC	2	6	197535	197540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939943
4061	NC_013851	TCG	2	6	197586	197591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939943
4062	NC_013851	GGC	2	6	197718	197723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939944
4063	NC_013851	CCA	2	6	197731	197736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939944
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4065	NC_013851	CGG	2	6	197752	197757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939944
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4068	NC_013851	GCCG	2	8	197882	197889	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
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4071	NC_013851	GCCG	2	8	197951	197958	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4072	NC_013851	GGA	2	6	198016	198021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939944
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4087	NC_013851	GAT	2	6	198314	198319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939944
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4092	NC_013851	CG	3	6	198555	198560	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4093	NC_013851	GC	3	6	198583	198588	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4094	NC_013851	GCA	4	12	198721	198732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
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4096	NC_013851	TCA	3	9	198784	198792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939944
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4101	NC_013851	GTGCC	2	10	199100	199109	0 %	20 %	40 %	40 %	288939945
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4244	NC_013851	GCTCCG	2	12	205302	205313	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288939951
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4360	NC_013851	GCG	2	6	210703	210708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939953
4361	NC_013851	CAT	2	6	210726	210731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939953
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4488	NC_013851	CGA	2	6	216663	216668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939960
4489	NC_013851	CG	3	6	216680	216685	0 %	0 %	50 %	50 %	288939960
4490	NC_013851	CGG	2	6	216752	216757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939960
4491	NC_013851	GCC	2	6	216809	216814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939961
4492	NC_013851	GGC	2	6	216823	216828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939961
4493	NC_013851	CGG	2	6	216910	216915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939961
4494	NC_013851	CG	3	6	216940	216945	0 %	0 %	50 %	50 %	288939961
4495	NC_013851	CGA	2	6	216994	216999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939961
4496	NC_013851	GCAT	2	8	217014	217021	25 %	25 %	25 %	25 %	288939961
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4500	NC_013851	TGC	2	6	217170	217175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939961

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